Program Sarjana Akuntansi (“UPA”) didirikan oleh Universitas Islam Sultan Agung (UNISSULA) pada tahun 1990 untuk menjawab meningkatnya kebutuhan lulusan di bidang akuntansi sebagai dampak dari pertumbuhan ekonomi. Pada bulan Agustus 2008, UPA mendapat status akreditasi dari Menteri Pendidikan dan Kebudayaan.
Setelah itu, UPA berhasil mempertahankan nilai “A”, akreditasi tertinggi dalam Pendidikan Indonesia, sebanyak 4 kali berturut-turut hingga saat ini. Alumni yang diwisuda dari UPA berjumlah lebih dari 3600 orang. UPA menampung dosen-dosen berkualitas di bidang akuntansi keuangan, akuntansi manajemen, akuntansi syariah, perpajakan, auditing akuntansi sektor publik.
UPA telah menjalin kerjasama dengan berbagai institusi dalam dan luar negeri, sebagai bagian dari internasionalisasi. Kerjasama yang dilakukan adalah dalam bidang pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat.